El objetivo del presente resumen es presentar el desarrollo de un panel de pruebas moleculares qPCR para la detección de agentes patógenos en sistemas de producción acuícola, como resultados de una serie monitoreos sanitarios realizados en sistemas de producción de tilapia y trucha arco iris en diferentes regiones de Colombia.
Por más de dos décadas se ha llevado a cabo un trabajo interdisciplinario y multi-institucional, que ha articulado diferentes actores claves para la industria acuícola en Colombia (productores, instituciones académicas, asociaciones de productores y la empresa de base biotecnológica), entorno a múltiples proyectos de investigación orientados a generar información sobre aspectos relevantes de los principales agentes patógenos que afectan los sistemas de producción de tilapia y trucha arcoíris, en diferentes regiones del país. Las investigaciones, se enfatizaron en identificar, aislar, caracterizar y diagnosticar los agentes más prevalentes en cada sistema productivo, para lo cual se emplearon diferentes métodos diagnósticos (microbiología, histopatología y biología molecular). En el marco de estos estudios se desarrollaron y validaron métodos moleculares (qPCR) diseñados sobre las secuencias de genes objetivo diagnóstico obtenidas de los agentes aislados e identificados en sistemas productivos locales, estas pruebas se convirtieron en el método de mayor relevancia para llevar a cabo programas de monitoreo sanitario y construcción de mapas epidemiológicos en sistemas productivos de tilapia en los Departamentos del Huila, Antioquia y Córdoba; en estanque y jaulas flotantes, como también la identificación de factores de riesgos que predisponen a la presencia de diferentes patógenos en sistemas de producción de trucha arco iris en el Departamento de Antioquia.
Las investigaciones empleando los métodos moleculares validados, han permitido determinar las prevalencias/frecuencias de los agentes más relevantes y previamente conocidos en aguas frías como: Flavobacterium psychrophilum y Aeromonona salmonicida; mientras para aguas cálidas: Streptococcus agalactiae y Edwarsiella tarda, de igual forma, permitieron la identificaron de agentes emergentes para nuestro entorno como el Streptococcus iniae.
Los avances de investigación obtenidos (desarrollo qPCR) se articularon con la empresa de base tecnológica Gentech Biosciences, con el objetivo de optimizar los esquemas de validación de las pruebas bajo un esquema con altos estándares, en laboratorios con elevado nivel tecnológico y producidos/acondicionados en plantas de producción que garantizan las Buenas Prácticas de Manufactura – BPM. El objetivo del presente documento es presentar a la comunidad involucrada con la producción acuícola y principalmente a los interesados en sanidad acuícola, el producto de este trabajo conjunto, que es portafolio de pruebas moleculares –qPCR para agentes de interés acuícola PATHOGENfish