Teniendo en cuenta la importancia del genoma en el conocimiento de una especie, en 2023 se publicó el primer borrador del genoma del bocachico (Prochilodus magdalenae) a partir del ADN de una hembra. A pesar de su valiosa importancia por haber sido la primera determinación del genoma de la especie, del género Prochilodus y de la familia Prochilodontidae, este ensamblaje inicial estaba muy fragmentado, dificultando su uso en análisis filogenéticos, ya que algunos genes podrían estar divididos en múltiples contigs. Por este motivo, se llevó a cabo un nuevo proceso de ensamblaje, para superar estas limitaciones y obtener una representación más completa y precisa del genoma del bocachico. El objetivo general de este estudio fue mejorar significativamente la calidad y contigüidad del genoma del bocachico (Prochilodus magdalenae) para obtener una representación más completa y precisa que facilite futuros estudios filogenéticos y moleculares de esta especie. La principal innovación fue la incorporación de secuencias de librerías de Hi-C, que proporcionaron información sobre las interacciones espaciales entre las regiones del genoma, logrando un ensamblaje a nivel de pseudocromosomas. El nuevo ensamblaje (Hembra v2), presenta 27 grandes scaffolds, correspondientes a los 27 cromosomas de la especie. Aunque el número total de contigs es mayor que en el ensamblaje original (Hembra v1), se observa un aumento considerable en el valor de N50 y una reducción notable en el valor de L50, sugiriendo que la mayoría de los contigs restantes pertenecen a secuencias altamente repetitivas, que no han podido ser ubicadas en los 27 pseudocromosomas. Para evaluar la calidad del nuevo ensamblaje se realizó adicionalmente un alineamiento con BLASTn con todas las secuencias disponibles de P. magdalenae en GenBank a mayo de 2024 (Tabla 1). Esta nueva versión del genoma de bocachico hembra representa una valiosa herramienta para investigadores interesados en estudios filogenéticos y moleculares de esta importante especie. La mayor contigüidad y calidad del ensamblaje permiten análisis más precisos y completos, abriendo nuevas posibilidades para comprender la biología y evolución de la especie.