La resistencia al virus del Síndrome de la Mancha Blanca (VSMB) y el peso corporal son criterios importan tes en las evaluaciones
genéticas en camaronicultura. L a disponibilidad de microarreglos con miles de Nucleótidos de Polimorfismo Simple (SNPs) para Litopenaeus vannamei
abre la oportunidad de mejorar las estimaciones de los parámetros genéticos al considerar la información genómica al mismo tiempo que la genealogía
disponible;
sin embargo, es importante evaluar su uso
en la estimación de parámetros genéticos. E l objetivo de este trabajo fue estimar los parámetros genéticos para la resistencia al VSMB y el peso a los 120 días en Litopenaeus vannamei, utilizando información genómica.
Se utilizó la información 176 familias de dos ciclos de la población de
l a empresa Maricultura del Pacífico ubicada en el noroeste de México.
En 2020 se generó un desafío controlado para eval uar la resistencia al VSMB (inó culo per os , 106 partículas virales /g) en camarones de 75 días de edad, s e obtuvo la supervivencia binaria
(sSMB) de 6108 camarones a las 144 horas post inoculación
y de ellos se genotiparon 1684. En
2021 se obtuvo el genotipo y peso a los 120 días (P120) de 824 individuos que crecieron en instalaciones controladas . S e incluyó la información del genotipo de los 429 progenitores d e ambas generaciones. Los genotipos fueron obtenidos con el panel AquaArray HD (50 K) vannamei®? ( Neogen®?), que contiene 50,811 SNPs. En el control de calidad se usó una tasa de llamado para SNP de 80%, frecuencia de alelo mayor menor a 0.01 y equilibrio de Hardy-Weinberg con p-value < 1x 10-6. Quedando 35,258 SNPs y 3,000 individuos. Para la estimación de heredabilidad
de
P120 días y sSMB
y la correlación genética
entre ellas, se usaron don enfoques: U n modelo animal tradicional (BLUP) y otro incluyendo la matriz de información
genómica (ssG BLUP). En ambos se consideraron como efectos fijos para la sSMB la tina de prueba y el peso al registro , mientras que para P120 el sexo y la edad , además de l efecto común de familia. S e utilizó el programa AIREMLF90.
Como se observa en el C uadro 1, con el enfoque de ssGBLUP las estimaciones de heredabilidad
se reducen los errores estándar en ambas características, lo que mejora su precisión. En la rG
fue consistentemente negativa y no significativa en ambos modelos, como se ha observado en otros estudios entre peso corporal e indicadores de resistencia a SMB.