CARACTERIZACIÓN Y CAMBIOS EN LA COMPOSICIÓN DE MICROBIOMAS EN BIOFLOC GENERADOS CON DIFERENTES FUENTES DE CARBONO EN CULTIVOS EXPERIMENTALES DE TILAPIA ROJA
Se determinó y analizó comparativamente la composición de los microbiomas presentes en un sistema de cultivo producción tilapia roja (Oreochromis spp.) con biofloc (BFT) utilizando diferentes fuentes de carbono. Los 4 tratamientos ejecutados fueron: melaza (MZA), almidón de yuca (Y), almidón de maíz (M) y un g rupo de control sin fuente de carbono, en una relación C:N de 15:1. El ensayo se realizó durante 60 días, en 12 tanques circulares de 500 L, se sembraron juveniles de tilapia roja a una densidad de 120 peces/m3 . Cada 15 días se tomaron muestras de biofloc mediante sedimentación en con os Imhoff, a 15mL de muestra líquida de biofloc se agregaron 30mL de etanol absoluto grado reactivo (>95%). A partir del ADN metagenómico extraído y purificado, se obtuvieron amplicones de región hipervariable V4 de genes 16S rRNA , se generaron librerías y se secuenciaron con tecnología Illumina. A partir de las lecturas obtenidas, se realizó un análisis de composición taxonómica de los microbiomas utilizando el flujo bioinformático QIIME y la taxonomía SILVA 132, su biodiversidad obser vada por medio diversas métricas, distancia entre muestras, tipos bacterianos estables compartidos y específicos de tratamiento. Patrones de composición en replicas biológicas experimentales independientes con diferente especímen en igual tiempo o condición, muestran core microbiome muy estables en tipos bacterianos encontrados (ver figura, patrones a nivel de género de todos las muestras analizadas), con detalles de diferencias significativas en la abundancia relativa de algunos géneros bacterianos detallados a continuación. Como resultados principales determinamos que : al inicio del experimento las comunidades tienen una composición conservada y constante de miembros predominantes clasificados como Cetobacterium, Bacteroidacea , Cellvibrio y Enterobacteriacea y con aumentos diferenciales y respuestas variadas en los tratamientos con adición de nutrientes, destacándose el aumento ligado a los tratamientos y el tiempo, de organismos degradadores de polisacáridos y resistentes a los productos de su metabolismo como Chitinophagacea , Propionibacterium y Flavobacterium.
