COMPARACIÓN DEL MICROBIOMA INTESTINAL DE LA TILAPIA ROJA Oreochromis spp. CULTIVADA EN BIOFLOC Y  SISTEMA DE RECIRCULACIÓN ACUÍCOLA

En e ste estudio se analiza la composición de microbiomas en el cultivo de tilapia roja bajo un sistema experimental de producción biofloc (BFT) y un sistema de recirculación acuícola (RAS). ltivaron juveniles de tilapia roja  Oreochromis spp. en seis tanques de 500 L , tres de ellos destinados al RAS y los otros tres al BFT. Se realizaron muestreos en los días 0, 15, 30, 45 y 60 (3 peces por tratamiento en cada muestreo ), los cuales fueron anestesiados,  sacrificados,  desinfectados y diseccionados para almacenar el intestino en nitrógeno líquido . Posteriormente, se transfirieron a etanol absoluto del 95% para enviar a análisis. De estas muestras se realizaron extracciones de ADN total, se amplificaron los fragmentos de gen 16S rRNA , se construyeron librerías de los amplicones y se secuenciaron por tecnología Illumina . Las secuencias obtenidas fueron analizadas por medio de un flujo bioinformático (QIIME) determinando alfa y beta diversidad (en la figura se observa el patrón de distancias UniFrac de todas las muestras, con diferenciación y cambios en el tiempo y según tratamiento). Adicionalmente se realizaron los patrones de clasificación taxonómica (SILVA 132) a diversos niveles de los tipos bacterianos detectados en todas las muestras, componentes de microbioma conservado entre muestras (core microbiome ) y grupos divergentes o característicos encontrados asociados a diferentes tiempos o tratamientos. Observamos una composición core microbiome 100% muy estable y son componentes estables del intestino de Tilapia roja en nuestro sistema experimental independiente del tratamiento o de la edad del espécimen. Por otra parte, se ve una clara colonización y aumento en la abundancia relativa de los tipos bacterianos asociados a los componentes de los flóculos y tipos bacterianos que cambian en cantidad relativa o están presentes asociados a e ste tratamiento. El sistema BFT influencia la composición del microbioma intestinal de tilapia en las condiciones utilizadas y promueve presencia y colonización de grupos bacterianos reportados como utilizados o asociados a probiosis en peces. Las muestras iniciales presentan una composición semejante, con una diversidad de tipos bacterianas alta, y con una distribución mayoritaria de bacterias clasificadas dentro de la familia Enterobacteriaceae , del orden Bacteroidales , o de los géneros Cetobacterium principalmente.  También  se observa que Sphingomonas es un componente importante d el microbioma. Estos son resultados parciales, los datos aún se encuentran en análisis.