Una buena alternativa para aumentar la producción de peces en los reservorios, es la acuicultura en jaulas flotantes, dado que ésta tiene muchas ventajas sobre la acuicultura convencional, debido a: 1) se desarrolla en cuerpos de agua existentes, 2) requieren un gasto de capital comparativamente bajo, y 3) usan tecnología simple; sin embargo, esta actividad emergente implica la introducción de cargas adicionales de nutrimentos, principalmente nitrógeno (N) y fósforo (P), lo que se puede traducir en una sobrecarga del sistema. Sin embargo, debido a la importancia que tienen los ciclos biogeoquímicos en la dinámica de los cuerpos de agua continentales y particularmente para la acuacultura no convencional, se realizó la estimación del balance hidrológico y de la capacidad de carga en dos embalses mexicanos : presa Ing. Fernando Hiriart Balderrama "Zimapán" ubicada en los límites de los estados de Querétaro e Hidalgo y la presa Lic. Gustavo Díaz Ordaz "Bacurato" en Sinaloa . Los resultados importantes indican que la presa Zimapán recibe los aportes principales de los afluentes de los ríos San Juan y Tula, mientras que para la presa Bacurato los aportes provienen del río Sinaloa. También se comprobó, de acuerdo con la relación N:P, que en ambas presas el fósforo fue el nutrimento limitante . De acuerdo al índice de Carlson la presa Zimapán se clasificó como un cuerpo de agua eutrófico , mientras que la presa Bacurato como mesotrófica . Dado que la presa Zimapán se encuentra eutrofizada, se estimó que es necesaria una biomasa de 12 795 t para pasar a un estado hipereutrófico en un año de cultivo. En la presa Bacurato se estimó una biomasa de 3 080 t, necesaria para pasar, en un año de cultivo, de un estado mesotrófico a uno eutrófico. Con estos resultados se concluye que la capacidad de carga del reservorio Zimapán se encuentra sobrepasada por lo que es necesario reducir la producción de peces ya existente o bien mejorar los procesos de producción a través de nuevas metodologías. En tanto que los resultados en la presa Bacurato indican que es posible desarrollar una acuacultura sustentable, utilizando un valor menor al estimado que se adecue a las necesidades de producción y en el cual se proteja la estabilidad del sistema.