El uso de vacunas en la acuicultura de salmones en Chile permite controlar el brote de varias enfermedades virales y bacterianas. Sin embargo, no se ha logrado establecer vacunas efectivas contra enfermedades parasitarias. El copépodo marino Caligus rogercresseyi es un ectoparásito conocido como piojos de mar. Esta especie es una de los principales patógenos que afecta el cultivo de salmón Atlántico . El desarrollo de estrategias de control basadas en vacunas para el control de piojos de mar no ha sido posible con los métodos clásicos para la identificación de antígenos candidatos. El objetivo de este estudio fue utilizar bases de datos transcriptómicas para identificar in silico candidatos potenciales a vacuna s para el control de C. rogercresseyi .
Los análisis se realizaron a partir de bases de datos transcriptómicas de las en diferentes etapas de desarrollo de C. rogercresseyi , obtenidas mediante secuenciación Illumina. Los contigs se compararon con la base de datos de proteínas de crustáceos y/o artrópodos que se elaboraron utilizando NCBI y UniProt . Se determinó el ORF de las secuencias identificadas y traducidas a secuencias proteicas. Seguidamente s e realizaron análisis múltiple de secuencias con otras proteínas conocidas. Los niveles de expresión de los candidatos se evaluaron mediante RNA-Seq y se validaron por RT-qPCR . Las pruebas de predicción in silico de epítopos T y B lineales fueron realizadas por el software BepiPred y TEPITOPE, respectivamente.
Como resultados, se identificaron dife rentes isoformas de peritrofina con diferencias en el número de dominios de unión a quitina, y una isoforma de DMT1 . Las dos proteínas mostraron patrones de expresión diferencial entre las etapas de desarrollo del piojo de mar. Además, se identificaron epítopos lineales de linfocitos B y T tanto en peritrofinas como en DMT1 . Estos resultados demuestran el potencial antigénico de las proteínas identificadas en C. rogercresseyi . En posterio res investigaciones, a través de pruebas in vivo en salmones cultivados, se demostrarán la acción inmunogénica de las peritrofinas y DMT1 contra el piojo de mar.
Agradecimientos: Este estudio fue financiado por FONDAP #15110027 y CONICYT-PCHA/Doctorado Nacional (Beca 2018-21180084).
e -mail address: acasuso@udec.cl